El pene tiene tres vías de entrada del VIH:

1. La pieza de la uretra situada dentro del pene o epitelio de la uretra, la parte que recubre la uretra, concretamente por unas células llamadas macrófagos, que se encargan de recibir los virus dañinos y neutralizarlos.
2. El extremo de la uretra conocida como la fosa navicular.
3. El bálano o glande, la membrana mucosa en la capa interna del prepucio.